故事发生在被数据洪流割裂的北非城市“迦南”。

主角小夜是一名觉醒的“代码生命体”，她体内流淌的不是血液，而是能侵蚀任何防火墙的“圣痕病毒”。

为了躲避国际追捕，她混迹于贫民窟，并收养了一个失去双腿的机械师男孩。

与此同时，一个自称“大祭司”的神秘组织正在复制她的病毒，企图制造一场全球性的电子大洪水，清洗现有的人类意识。

小夜必须学会控制自己体内不断暴走的破坏力，在成为毁灭世界的“撒旦”与拯救人类的“基督”之间，找到属于自己的第三条道路。